Пріоритетні напрями діяльності Центру українсько-європейського наукового співробітництва:
- допомога вченим України в участі в міжнародних наукових конференціях та в науково-педагогічних стажуваннях, які відбуваються на базі закладів вищої освіти, наукових інститутів, науково-технічних парків, наукових професійних громадських організацій у сусідніх до України державах (Республіці Польща, Угорщині, Румунії, Словацькій Республіці);
- проведення наукових аналітичних досліджень, спрямованих на вивчення досвіду діяльності закладів вищої освіти, наукових установ та суб’єктів публічного адміністрування у сфері освіти й науки держав – членів Європейського Союзу щодо організації навчального процесу та здійснення наукової діяльності, а також державної атестації наукових кадрів;
- організація інституціональних візитів до міжнародних і європейських інституцій, органів державної влади держав – членів Європейського Союзу, європейських закладів вищої освіти для вітчизняних студентів, аспірантів, молодих викладачів та науковців із метою вивчення ними найкращих досягнень країн Європейського Союзу як у сфері освіти й науки, так і в галузі державного будівництва загалом;
- інформування вчених України про можливості публікації своїх наукових здобутків у зарубіжних колективних монографіях і наукових журналах провідних закладів вищої освіти сусідніх до України держав (Республіки Польща, Угорщини, Румунії, Словацької Республіки) разом із колегами – вченими із цих країн;
- організація наукових конференцій, тренінгів, семінарів та круглих столів у мальовничих місцях Закарпатської області для українських учених із запрошенням як головних спікерів провідних науковців, тренерів, державних діячів сусідніх до України держав – членів Європейського Союзу;
- участь членів Центру українсько-європейського наукового співробітництва в обговоренні численних проектів нормативно-правових актів у сфері науки та вищої освіти, які наразі пропонуються Міністерством освіти і науки України для ознайомлення, з огляду на вивчений досвід держав – членів Європейського Союзу у відповідній сфері.